自闭症的发病原因目前尚无定论，是由综合因素造成，其中有研究证明遗传占有主导因素，但具体的发病机制还有待研究：

1、遗传因素：如果是单卵双生子同时患自闭症的概率可以达到82%，如果是双卵双生子同病率可以达到10%，所以现在认为自闭症和遗传有很大的关系；

2、围产期的高危因素：比如在围产期，就是怀孕或出生的时候有感染，比如巨细胞病毒或者弓形体感染，或者存在早产的因素，这些孩子发生自闭症的几率会增高；

3、与神经系统的发育有关：比如进行功能性磁共振检查，可发现自闭症孩子的大脑某些功能区发育得不是很好，比如额区、颞区，或者杏仁核、海马回等大脑的边缘系统，即与人类情绪有关的区域发育有异常。